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  新医学  2017, Vol. 48 Issue (10): 732-735  DOI: 10.3969/j.issn.0253-9802.2017.10.012
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范仕兵, 冯清林, 刘明冬, 李骥. 核糖体蛋白L23在胶质母细胞瘤中的临床意义[J]. 新医学, 2017, 48(10): 732-735.
Fan Shibing, Feng Qinglin, Liu Mingdong, Li Ji. Clinical significance of ribosomal protein L23 in glioblastoma[J]. Journal of New Medicine, 2017, 48(10): 732-735.

基金项目

重庆市卫生计生委医学科研项目面上项目(2016MSXM121)

通讯作者

冯清林, E-mail:iceman_feng_dr@163.com

文章历史

收稿日期:2017-04-25
核糖体蛋白L23在胶质母细胞瘤中的临床意义
范仕兵, 冯清林, 刘明冬, 李骥     
404000 重庆, 重庆三峡中心医院神经外科
摘要: 目的 探讨核糖体蛋白(RP)L23在胶质母细胞瘤(GBM)中的临床意义。方法 以3个独立的GBM基因表达数据集GSE42669、GSE7696以及GSE4290为研究对象,分析RPL23基因在正常脑组织和GBM组织中表达的差异,RPL23基因与GBM患者无进展生存期以及总生存期的关系,并运用基因探针富集分析(GSEA)法进一步探讨RPL23基因对GBM细胞增殖的作用机制。结果 RPL23基因在GBM组织中的表达低于正常脑组织(P < 0.0001),高表达RPL23基因的GBM患者无进展生存期(Log-rank P < 0.0001,HR=5.347,95% CI:2.568~11.060)、总生存期(Log-rank P=0.0046,HR=3.372,95% CI:1.680~6.767)均优于RPL23低表达者。GSEA方法结果提示RPL23基因可能通过p53信号通路、IL6-JAK-STAT3信号通路、IL2-STAT5信号通路、KRAS信号通路、PI3K-AKT-mTOR信号通路、细胞凋亡、WNT/β-Catenin信号通路以及NOTCH信号通路等生物学过程影响GBM细胞增殖。结论 RPL23可能是GBM患者独立的保护性因素,高表达RPL23基因的GBM患者临床预后更好。
关键词: 胶质母细胞瘤    核糖体蛋白L23基因    临床预后    
Clinical significance of ribosomal protein L23 in glioblastoma
Fan Shibing, Feng Qinglin, Liu Mingdong, Li Ji     
Department of Neurosurgery, Chongqing Three Gorges Central Hospital, Chongqing 404000, China
Corresponding author: Feng Qinglin, E-mail:iceman_feng_dr@163.com
Abstract: Objective To investigate the clinical significance of ribosomal protein (RP)L23 in glioblastoma(GBM). Methods Three independent GBM gene expression databases of GSE42669, GSE7696 and GSE4290 were employed to analyze the differential expression of RPL23 gene between GBM and normal brain tissues. The relationship between RPL23 gene and progression-free survival and overall survival of GBM patients was investigated. Gene set enrichment analysis (GSEA) was adopted to explore the mechanism underlying the effect of RPL23 gene upon GBM cell proliferation. Results The expression level of RPL23 gene in the GBM tissues was significantly down-regulated compared with that in the normal brain tissues (P < 0.05). The progression-free survival (Log-rank P < 0.0001, HR=5.347, 95% CI:2.568-11.060) and overall survival (Log-rank P=0.0046, HR=3.372, 95% CI:1.680-6.767) in GBM patients with high expression levels of RPL23 gene were significantly longer than those in their counterparts with low expression levels of RPL23. GSEA results prompted that RPL23 gene might affect the GBM cell proliferation probably through p53, IL6-JAK-STAT3, IL2-STAT5, KRAS, PI3K-AKT-mTOR, WNT/β-Catenin and NOTCH signaling pathways, cellular apoptosis and alternative biological processes. Conclusions RPL23 is probably an independent protective factor for GBM patients. GBM patients with high expression levels of RPL23 gene obtain better clinical prognosis than their counterparts with low expression levels of RPL23.
Key words: Glioblastoma    Ribosomal protein L23 gene    Clinical prognosis    

脑胶质瘤是最常见的颅内恶性肿瘤,其中以胶质母细胞瘤(GBM)最为常见,约占胶质瘤的50%[1-4]。由于GBM具有较强的侵袭性,极易对周围组织造成损伤,传统的治疗手段难以有效杀死全部肿瘤细胞,当前GBM具有较高的致死率和复发率,即使是经历最大范围的手术安全切除了肿瘤,且术后采用经典的STUPP方案行替莫唑胺同步放射及化学治疗后的GBM患者,其中位生存期也仅为14.6个月,而5年生存率则仅为9.8%[5-7]。近年来,随着分子生物学技术的研究进展,GBM的治疗逐渐迈入分子靶向治疗阶段[8-9]。核糖体蛋白(RP)L23定位于核仁,其mRNA包含5个外显子,位于人类17号常染色体,分子量为15 kD。有研究报道,RPL23在多种肿瘤中异常表达[11]。另有研究报道RPL23的高表达能够抑制胃癌细胞的增殖,并有望成为胃癌靶向治疗的分子靶点[12]。然而笔者见目前尚无研究报道RPL23对GBM细胞作用机制,因此分析了GBM基因表达数据集,探讨RPL23在GBM中的临床意义。

对象与方法 一、研究对象

在基因表达综合数据库(GEO)下载GBM患者基因表达数据集GSE42669、GSE7696以及GSE4290[13-16]。各基因表达数据集的情况如下,GSE42669:采用Affymetrix公司的HuGene-1_0-st基因表达芯片对58例GBM患者的临床样本进行基因表达谱检测,该数据集提供了55例GBM患者生存的信息[13]。GSE7696:采用了HG-U133_Plus_2基因表达芯片对80例GBM患者及4例正常对照者的脑组织(医学伦理审查资料由原作者提供,下同)进行基因表达谱检测,该数据集提供了80例GBM患者的生存信息[14-15]。GSE4290:采用了Affymetrix公司的HG-U133_Plus_2基因芯片,并采用“Affy”程序包进行预处理,得到GBM和正常脑组织中HG-U133_Plus_2探针集中所有基因的相对表达值水平,该数据集提供了77份GBM样本和23份正常脑组织的基因表达谱数据[16]

二、方法

使用上述3个基因表达数据集分析RPL23在GBM和正常脑组织中的表达情况,探讨RPL23基因表达与GBM临床预后的相关性,同时研究其可能的作用机制。具体步骤如下,首先分析RPL23(探针号:200888_s_at)在GSE4290中的GBM临床样本和正常脑组织中的表达情况。以RPL23(探针号:8014749) 在GSE42669所有样本中表达水平的中位数将该数据集中的GBM样本分为RPL23高表达组和RPL23低表达组,分析2组患者无进展生存期及总生存期的差异。同样的根据RPL23在GSE7696中表达水平的中位数,将该数据集中的GBM样本分为RPL23高表达组与RPL23低表达组,以基因探针富集分析(GSEA)官网的MsigDB数据库中下载的hallmark基因集作为参考基因集,置换次数为1 000次,以P<0.05、错误发现率(FDR)<0.25, 使用GSEA法分析RPL23基因对GBM细胞增殖可能的作用机制。

三、统计学处理

采用SPSS 21.0处理统计学数据。计量资料以x±s表示。使用Log-rank法对RPL23高表达和RPL23低表达组GBM患者的无进展生存期和总生存期进行分析,并运用Graphpad 5.0软件绘制相应的生存曲线;使用两独立样本t检验比较RPL23基因在GBM组织和正常脑组织中表达的差异。P<0.05为差异有统计学意义。

结果 一、GBM和正常脑组织RPL23表达的比较

分析GSE4290表明,RPL23基因在GBM中的相对表达值为7 607.0 ±1 699.3,低于正常脑组织中的相对表达值13 380.0±4 014.1(t=6.703,P<0.001)。

二、RPL23高表达组和RPL23低表达组GBM患者预后的比较

分析GSE42669表明,RPL23高表达组无进展生存期优于RPL23低表达组(P<0.0001),见图 1A;RPL23高表达组的总生存期优于RPL23低表达组(P=0.0046),见图 1B

图 1 GSE42669中RPL23高表达组和RPL23低表达组GBM患者预后比较
三、RPL23基因对GBM细胞增殖的作用

GSEA法分析结果示,RPL23低表达组主要富集了p53信号通路、IL6-JAK-STAT3信号通路、IL2-STAT5信号通路、KRAS信号通路、PI3K-AKT-mTOR信号通路、细胞凋亡、WNT/β-catenin信号通路以及NOTCH信号通路,提示RPL23可能通过以上信号通路或生物学过程影响GBM细胞增殖,影响GBM患者临床预后,见表 1

表 1 SEA法分析结果
讨论

如前所述,GBM是中枢神经系统常见的恶性肿瘤之一,GBM患者的临床预后极差。目前亟待开发GBM的靶向治疗及诊断危险分层策略。本研究通过再次挖掘已经公开发表的3个独立GBM基因表达数据集,明确RPL23基因在GBM细胞中明显低于其相应的正常组织,高表达RPL23的GBM患者临床预后(无进展生存期及总生存期)明显优于RPL23低表达患者。基于RPL23低表达的GBM的GSEA结果表明RPL23基因可能通过p53信号通路、IL6-JAK-STAT3信号通路、IL2-STAT5信号通路、KRAS信号通路、PI3K-AKT-mTOR信号通路、细胞凋亡、WNT/β-catenin信号通路以及NOTCH信号通路影响GBM细胞增殖,进而影响GBM患者的临床预后。

事实上,目前已经有多篇报道提示RPL23参与多种肿瘤细胞的增殖。Meng等[17]的动物实验表明,RPL23的表达依赖于mTOR的功能,并介导p53通路相关的肿瘤抑制作用。Zhang等[18]的研究也表明,在胃癌细胞中RPL23通过抑制p53-MDM2相互作用关系而维持p53作用,以发挥诱导细胞周期阻滞和凋亡的抗肿瘤作用。另一方面,Zhang等[19]的研究表明,RPL23协同去折叠蛋白反应(unfolded protein response)参与p53依赖的细胞周期阻滞。我们的研究结果表明,低表达RPL23基因的GBM临床样本主要富集在p53相关信号通路,提示在GBM细胞中,RPL23基因的低表达可能通过调节p53相关信号通路而抑制肿瘤细胞。Wu等[20]的研究表明骨髓增生异常综合征患者的肿瘤细胞RPL23的高表达与其凋亡抑制密切相关,高表达RPL23患者临床预后更差。因此,对于本研究来说,RPL23基因对GBM的具体作用机制,尚有待进一步的分子生物学实验验证。

p53基因已经参与体内多种肿瘤的发生和发展。DNA损伤、遗传毒性、癌基因激活、细胞间联系缺失、低氧以及异常增殖通路等多种癌变诱因均能够诱导p53基因激活[21]。Lee等[22]证明Znf179能够通过p53依赖的细胞周期途径诱导多形性成胶质细胞瘤细胞生长停滞并分化。Quan等[23]的研究表明,抑制p53下游分子PIG3能够促进GBM细胞增殖并预示着患者不良预后。Clark等[24]的研究也表明,在GBM细胞中白藜芦醇靶向p53基因,诱导p53基因的表达与激活,并促进其下游分子的转录,进而发挥白藜芦醇抑制GBM细胞增殖和浸润的作用。由此可见,使用药物靶向激活p53或者下调p53的表达能够分别抑制或促进GBM细胞的增殖,并影响GBM患者的临床预后。我们的研究表明,低表达RPL23的GBM临床样本主要富集p53等多种信号通路或生物学过程,提示RPL23基因可能通过p53相关通路影响GBM细胞的增殖,但是具体的作用机制有待进一步证实。以上分析表明,RPL23可能为GBM患者的独立保护性因素。

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